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范德堡大學分子進化專業碩士課程輔導

作者：海馬發布時間：2022-12-28 09:21:56

分子進化是進化生物學的一個領域，研究在DNA序列水平上的進化變化。它包括研究序列變化的速率，適應性和中性變化的相對重要性，以及基因組結構的變化。

一、基因的分子系統發育

自20世紀80年代以來，獲得DNA核苷酸序列的方法有了極大的改進，并在很大程度上實現了自動化。許多生物體的許多基因已經被測序，從人類到病毒的各種物種的完整基因組已經被測序。在研究基因復制方面，DNA序列的使用特別有意義。編碼人類和其他哺乳動物的血紅蛋白的基因提供了一個很好的例子。

對血紅蛋白鏈和肌紅蛋白(一種密切相關的蛋白質)的氨基酸序列的了解，使我們有可能重建產生相應基因的復制的進化歷史。但對這些蛋白質編碼基因中的核苷酸序列的直接檢查表明，情況比從蛋白質序列中看到的更復雜，也更有趣。

二、多重性和速率異質性

細胞色素c僅由104個氨基酸組成，由312個核苷酸編碼。然而，這種短小的蛋白質儲存了巨大的進化信息，這使得相當好的近似結果成為可能，如圖所示，20個非常不同的物種在超過10億年的時間里的進化歷史。但細胞色素c是一種緩慢進化的蛋白質。差異很大的物種在它們的細胞色素c中具有很大一部分共同的氨基酸，這使得研究只有遙遠關系的生物體之間的遺傳差異成為可能。然而，由于同樣的原因，比較細胞色素c分子不能確定密切相關物種之間的進化關系。

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